В письме от 17.02.2012 № 03-03-06/1/90 Минфин России рассмотрел следующую ситуацию. Организация заключила трудовой договор с физическим лицом, которое проходит обучение в высшем учебном заведении. На момент приема на работу у организации не было возможности возмещать работнику расходы на обучение из-за нестабильного финансового положения. Такая возможность у организации появилась спустя два года.

По мнению финансового ведомства, организация имеет право стоимость обучения, возмещаемую работнику за оставшийся период учебы в ВУЗе, учитывать в расходах при формировании налоговой базы по налогу на прибыль при выполнении условий, установленных пунктом 3 статьи 264 НК РФ. Напомним, что согласно этому пункту расходы на обучение работника, с которым заключен трудовой договор, включаются в состав прочих расходов, если это обучение осуществляется на основании договора с российским образовательным учреждением, имеющим соответствующую лицензию, либо иностранным образовательным учреждением, имеющим соответствующий статус.

По данному вопросу см. также Справочник "Налог на прибыль"