Если договор, в счет которого получен аванс, расторгается либо меняются его условия, продавец (поставщик) вправе принять к вычету НДС, уплаченный с такого аванса только при условии, что он возвратил покупателю данную предоплату (абз. 2 п. 5 ст. 171 НК РФ). В споре, рассмотренном АС Центрального округа, предприниматель не исполнил условия договора поставки и аванс не вернул. Он заключил соглашение о новации, по которому его обязательства по указанному договору были заменены на займ. После этого предприниматель отразил в декларации вычет НДС, исчисленный им ранее с суммы предоплаты. Инспекция отказала в вычете, посчитав, что требования абз. 2 п. 5 ст. 171 НК РФ не соблюдены. Суд поддержал позицию проверяющих. В постановлении от 18.08.2015 № Ф10-2702/2015 суд отметил, что при новации происходит замена первоначального обязательства другим обязательством (ст. 414 ГК РФ). То есть фактически не происходит возврата денежных средств. А для целей вычета НДС такой возврат является обязательным условием, предусмотренным положениями НК РФ, это означает, что при новации вычет неправомерен.

Следовательно, инспекция обоснованно отказала налогоплательщику в вычете налога. Подробнее о том, можно ли принять к вычету НДС с аванса, если он не возвращается, а становится займом в результате новации, см. статью-рекомендацию справочника "Налог на добавленную стоимость".

Дополнительно отметим, что по вопросу новации и исчисления НДС с аванса у судов следующая позиция: если продавец в счет предстоящей поставки товаров (выполнения работ, оказания услуг) по договору получил предоплату, но ему точно известно, что до окончания квартала такой платеж будет новирован в заемное обязательство, он вправе не исчислять и не уплачивать НДС с предоплаты.
АС Западно-Сибирского округа в постановлении от 19.08.2015 № Ф04-21660/2015 аргументировал это следующим. Заемные операции объектом обложения НДС не являются (пп. 15 п. 3 ст. 149 НК РФ). Налоговая база по общему правилу определяется по итогам налогового периода (п. 1 ст. 54 НК РФ). Соответственно, поскольку на конец квартала обязательства по договору поставки отсутствуют (поскольку заменены займом), обязанности уплатить налог не возникает.