Организация, имеющая несколько обособленных подразделений на территории одного субъекта РФ, может уплачивать налог на прибыль в бюджет этого субъекта через ответственное подразделение (п. 2 ст. 288 НК РФ). Однако в силу разных причин это подразделение может закрыться.

В письме от 13.09.2017 № СД-4-3/18247 ФНС России разъяснила, как в такой ситуации перейти на уплату налога на прибыль через оставшееся подразделение (в письме рассмотрен вопрос, когда организация имела два обособленных подразделения на территории одного субъекта РФ).

Налоговое ведомство отметило следующее. При закрытии ответственного подразделения у организации меняется порядок уплаты налога на прибыль в бюджет данного субъекта РФ, так как налог необходимо уплачивать через оставшееся подразделение. Поэтому по нормам Налогового кодекса организация должна уведомить об этом соответствующие налоговые органы.

Формы уведомлений и порядок их направления установлены письмом ФНС России от 30.12.2008 № ШС-6-3/986. Согласно этому порядку организация должна направить Уведомление № 1 в налоговый орган по месту нахождения оставшегося подразделения и копию этого уведомления – в налоговый орган по месту нахождения организации. По месту нахождения закрытого ответственного подразделения необходимо направить Уведомление № 2.

О порядке исчисления налога на прибыль по обособленным подразделениям см. в справочнике "Налог на прибыль организаций".