Принять к вычету НДС, уплаченный при ввозе товаров на территорию РФ, налогоплательщик может только при наличии документов, подтверждающих фактическую уплату сумм налога (п. 1 ст. 172 НК РФ).

Таможенная декларация (в числе прочих документов) оформляется при ввозе товаров. По действующим правилам налогоплательщик подает декларацию в таможенные органы и получает от них (с соответствующими отметками) в электронной форме.

В письме от 01.09.2017 № АС-4-15/17430 ФНС России разъяснила, что отсутствие у налогоплательщика копии указанной таможенной декларации на бумажном носителе не препятствует вычету НДС, поскольку декларация подтверждает не уплату налога, а ввоз товаров на территорию РФ.

Что касается подтверждения фактической уплаты НДС по ввезенным товарам, то одним из таких документов является подтверждение уплаты таможенных пошлин и налогов, которое выдается таможенным органом по требованию налогоплательщика по форме, утв. приказом ФТС России от 23.12.2010 № 2554.

Подробнее о том, какими документами можно подтвердить уплату НДС при импорте, см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".