В соответствии с абз. 1 п. 1 ст. 78.1 БК РФ в бюджетах предусматриваются субсидии бюджетным и автономным учреждениям на финансовое обеспечение выполнения государственного (муниципального) задания. Субсидии рассчитываются с учетом нормативных затрат на оказание государственных (муниципальных) услуг физическим и (или) юридическим лицам и нормативных затрат на содержание имущества.

Согласно п. 3 инструкции, утв. приказом Минфина России от 01.12.2010 № 157н, бухгалтерский учет ведется методом начисления. Поэтому учредитель признает обязательства и относит их на финансовый результат текущего года при наступлении даты предоставления субсидии в соответствии с условиями соглашения, причем вне зависимости от факта перечисления денег.

Расходы бюджетов на предоставление субсидий бюджетным и автономным учреждениям на финансовое обеспечение задания относятся на элемент вида расходов 611 или 621 в зависимости от типа учреждения в увязке с подстатьей 241 КОСГУ. Для учета расчетов учредителя по субсидии предназначен счет 1 302 41 000 "Расчеты по безвозмездным перечислениям государственным и муниципальным организациям".

В новых практических статьях справочника хозяйственных операций по "1С:БГУ 8" для казенных учреждений показано, как учредителю отразить в программе начисление и перечисление субсидии на выполнение задания.