Организации с обособленными подразделениями в общем случае налог на прибыль, подлежащий зачислению в бюджеты субъектов РФ, уплачивают по месту нахождения организации и по месту нахождения обособленных подразделений.

Однако если организация и ее обособленные подразделения находятся на территории одного субъекта РФ, то налог на прибыль, подлежащий зачислению в бюджет этого субъекта РФ, организация вправе полностью уплачивать в налоговый орган по месту своего нахождения. Соответственно, по месту нахождения подразделений налог на прибыль в этом случае не уплачивается.

Такие разъяснения даны в письме Минфина России от 03.07.2017 № 03-03-06/1/41778.

Минфин отметил, что в случае принятия соответствующего решения организация должна уведомить о нем налоговые органы по месту нахождения обособленных подразделений до 31 декабря года, предшествующего тому налоговому периоду, с которого организация будет применять новый порядок уплаты налога. При этом декларация по налогу на прибыль в такой ситуации представляется также только в налоговый орган по месту нахождения организации.

Подробнее об уплате налога на прибыль по обособленным подразделениям см. в справочнике "Налог на прибыль организаций".