При торговле между государствами-членами Евразийского экономического союза (ЕАЭС) порядок исчисления и уплаты НДС регулируется Протоколом о порядке взимания косвенных налогов (Приложение № 18 к Договору о Евразийском экономическом союзе от 29.05.2014 г.). В п. 3 Протокола указано, что в случае экспорта товаров с территории одного государства-члена ЕАЭС на территорию другого государства-члена ЕАЭС применяется нулевая ставка НДС (при надлежащем документальном подтверждении). При этом каких-либо особенностей в налогообложении авансов, полученных в счет будущей экспортной поставки, Протокол не содержит. Поэтому в подобном случае нужно руководствоваться нормами внутреннего законодательства страны-экспортера.

Согласно абз. 4 п. 1 ст. 154 НК РФ в базу по НДС не включается предоплата, полученная в счет предстоящих поставок товаров, которые облагаются налогом по ставке 0 процентов. Следовательно, при экспорте товаров из России на территорию государства-члена ЕАЭС поступившая от контрагента предоплата НДС не облагается. Данный вывод представлен в письме Минфина России от 30.04.2015 № 03-07-13/1/25440.

Подробнее об НДС при экспортных операция в страны ЕАЭС см. справочник "Налог на добавленную стоимость".