Как известно, нулевая ставка НДС применяется в отношении транспортно-экспедиционных услуг, оказываемых по договору транспортной экспедиции при организации международной перевозки. Перевозка является международной, если товары перемещаются между пунктами отправления и назначения, один из которых находится за пределами РФ (пп. 2.1 п. 1 ст. 164 НК РФ).

Однако экспедитор может оказывать услуги в рамках отдельного договора по перевозке импортного товара между двумя пунктами на территории РФ.

По мнению финансового ведомства, транспортно-экспедиционные услуги, оказываемые российской организацией при перевозке товара между двумя пунктами по территории РФ по отдельному договору, облагаются по ставке НДС 18 процентов.

К такому выводу пришел Минфин России в письме от 20.02.2016 № 03-07-11/9630.

Однако такой подход не является единственным. Некоторые суды исходят из того, что экспедитор все-таки может применять нулевую ставку НДС в данном случае.

Подробнее о применении ставки НДС экспедитором см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".