Организация может получить лицензию в лицензирующем органе одного субъекта РФ, а деятельность осуществлять в другом. В подобном случае она должна уведомить лицензирующий орган другого субъекта РФ (п. 5 ст. 9 Федерального закона от 04.05.2011 № 99-ФЗ "О лицензировании отдельных видов деятельности"). Нарушение данной процедуры извещения не приводит к утрате лицензии. Кроме того, в таком случае налогоплательщик не лишается права на льготу по НДС по лицензируемым видам деятельности. К таким выводам пришел АС Уральского округа в постановлении от 09.10.2014 № Ф09-6847/14.

Условия применения льгот по НДС подробно рассмотрены в справочнике "Налог на добавленную стоимость".