При распределении доли выбывшего из ООО участника у оставшихся возникает облагаемый НДФЛ доход.
Минфин России в письме от 05.08.2014 № 03-04-05/38557 рассмотрел следующую ситуацию. При выходе физического лица из ООО его доля распределяется между оставшимися участниками. В таком случае у последних возникает доход, облагаемый НДФЛ. Его размер следует определять исходя из действительной стоимости доли выбывшего участника и соответствующей части доли в уставном капитале, полученной каждым участником.
Причем согласно п. 18 ст. 217 НК РФ освобождение от НДФЛ в данном случае не применяется, поскольку доход получен от распределения доли вышедшего участника, а не в результате переоценки основных фондов (средств). Такую позицию финансовое ведомство занимало и ранее (см. письма от 15.03.2013 № 03-04-06/8031, от 28.02.2013 № 03-04-06/5947, от 27.02.2012 № 03-04-05/3-226).
Подробнее см. справочник "Налог на доходы физических лиц".