Напомним, что законодательство позволяет налогоплательщикам, осуществляющим указанные в ст. 149 НК РФ операции, не уплачивать НДС. При этом по видам деятельности, поименованным в п. 3 ст. 149 НК РФ, от данной льготы можно отказаться. Для этого не позднее 1-го числа налогового периода, с которого планируется не применять освобождение от НДС, необходимо подать в инспекцию соответствующее заявление (п. 5 ст. 149 НК РФ). Отметим, что НК РФ не устанавливает, какие последствия для налогоплательщика наступают, если данное заявление подано с нарушением срока. Таким образом, возникает вопрос, можно ли отказаться от льготы по п. 3 ст. 149 НК РФ, если заявление об отказе не подано в срок. Налоговые органы в такой ситуации придерживаются мнения, что если срок подачи уведомления нарушен, то отказаться от рассматриваемой льготы нельзя (см., например, письмо ФНС России от 26.08.2010 № ШС-37-3/10064). Однако ФАС Западно-Сибирского округа, рассматривая схожую ситуацию, в постановлении от 21.03.2014 № А27-2557/2013 занял иную позицию. Суд указал, что право не применять освобождение от НДС зависит от волеизъявления налогоплательщика. При этом получать какое-либо разрешение налогового органа не требуется. Таким образом, отказаться от применения льготы, предусмотренной п. 3 ст. 149 НК РФ, можно, даже если заявление не подано в срок.

Подробнее о том, может ли налогоплательщик отказаться от льготы, если он подал заявление об отказе с нарушением установленного срока, см. Справочник "Налог на добавленную стоимость".