Если поставка товаров (работ, услуг) не состоялась по причине расторжения или изменения условий договора, продавец может принять к вычету "авансовый" НДС, уплаченный ранее в бюджет (п. 5 ст. 171 НК РФ). Для этого он должен возвратить покупателю полученную предоплату. В письме от 01.04.14 № 03-07-РЗ/14444 Минфин России разъяснил, что это условие будет выполнено, если стороны засчитают суммы предоплаты, перечисленные друг другу по разным договорам. НДС по таким авансам продавец сможет заявить к вычету в периоде заключения соглашения о взаимозачете. Однако если аванс по расторгнутому договору засчитывается в счет предоплаты по новому договору, то продавец сможет принять "авансовый" НДС к вычету не в периоде взаимозачета, а после реализации товаров (работ, услуг) по новому договору. Кроме того, при новации обязательства по возврату аванса в заем предоплата не возвращается, поэтому продавец не сможет применить вычет НДС с аванса по п. 5 ст. 171 НК РФ. Однако есть альтернативные точки зрения по данным вопросам. Подробнее см.:

• Можно ли применить вычет НДС с аванса, если вместо его возврата произведен взаимозачет?
• Можно ли принять к вычету НДС с аванса, если он не возвращается, а становится займом (новация)?