Подключение к ГИС МП производится организацией. Обособленные подразделения (в том числе филиалы и торговые точки) отдельно подключать не нужно. Идентификатор в ГИС МП получается на головную организацию (учитывается только ИНН, КПП не фигурирует). Движение маркируемых товаров отслеживается только между организациями. Внутренние перемещения между обособленными подразделениями в ГИС МП не учитываются. Также в ГИС МП не отражается информация о том, в каком конкретно подразделении организации находится код маркировки.