С помощью расширения можно доработать существующие в конфигурации подсистемы. Для этого надо заимствовать подсистему в расширение и добавить в нее собственные или заимствованные объекты. Удалить объекты, уже присутствующие в заимствованной подсистеме, вы не сможете.
Кроме того, в случае если расширение дополняет функциональность конфигурации, можно добавить в расширение собственную подсистему и включить в нее как собственные, так и заимствованные объекты.