Удержание стоимости коммунальных услуг из зарплаты сотрудника не входит в перечень удержаний по инициативе работодателя согласно ст. 137 ТК РФ. Это удержание из зарплаты производятся работодателем только с письменного заявления сотрудника. Сотрудник может распорядиться своей заработной платой по своему усмотрению, в том числе предоставить работодателю заявление в произвольной форме на удержание из заработной платы и оплату стоимости коммунальных услуг. Удержания из зарплаты сотрудника по его инициативе производятся без ограничений.
О том, как в программах "1С:Зарплата и управление персоналом 8" (ред. 3) и "1С:Бухгалтерия 8" (ред. 3.0) удержать из зарплаты сотрудника такие суммы, читайте в новой статье справочника "Кадровый учет и расчеты с персоналом в программах 1С":