О том, как в "1С:Бухгалтерии 8" (ред. 3.0) при применении УСН с объектом "доходы минус расходы" отразить расходы на приобретение товаров по внешнеэкономическому контракту (импорт из стран, которые являются членами ЕАЭС) и на уплату ввозного НДС, см. в новой статье справочника "Учет при применении УСН":