Выплата зарплаты через банк может перечисляться на личные банковские счета работников или осуществляться в рамках зарплатного проекта. При использовании зарплатного проекта по договоренности с банком для работников централизованно открываются лицевые счета.
О том, как в программах "1С:Зарплата и управление персоналом 8" (ред. 3) и "1С:Бухгалтерия 8" (ред. 3.0) оформить выплату зарплаты через банк и как сформировать файлы для передачи в банк в электронном виде, читайте в актуализированных статьях справочника "Кадровый учет и расчеты с персоналом в программах 1С":