Законодательством предусмотрены случаи, когда "входной" НДС учитывается в стоимости приобретенных товаров (имущества). Тогда при их реализации налоговая база определяется в особом порядке. Как рассчитать такую базу, заполнить счет-фактуру и в чем состоят другие особенности подобных операций, смотрите в обновленных статьях справочника "Налог на добавленную стоимость". Подробнее см.:

• НДС при реализации имущества, учтенного с "входным" НДС
• Нужно ли уплачивать НДС, если межценовая разница нулевая или отрицательная?
• Как оформить счет-фактуру при уплате НДС с межценовой разницы?
• Как определяется налоговая база при реализации имущества, в стоимости которого учтена часть "входного" НДС?