В соответствии с п. 1 ст. 130 ГК РФ объекты незавершенного строительства относятся к недвижимому имуществу. Бюджетные (автономные) учреждения не вправе отчуждать либо иным способом распоряжаться недвижимым имуществом без согласия собственника (пп. 2, 3 ст. 298 ГК РФ). Следовательно, списать объекты незавершенного строительства учреждение может только по согласованию с собственником в лице учредителя, уполномоченного органа по управлению имуществом.

В отдельных случаях для списания затрат на строительство объекта от уполномоченного органа власти должно быть получено заключение о прекращении реализации целевой программы (бюджетных инвестиций) по объекту (письма Минфина России от 18.04.2014 № 02-06-10/18171, от 16.04.2014 № 02-06-10/17450).

В публично-правовом образовании могут быть установлены дополнительные требования по списанию капитальных вложений в объекты нефинансовых активов (письмо Минфина России от 13.06.2013 № 02-06-10/21931).

Капитальные вложения в объекты основных средств, нематериальных активов, которые не были созданы (не признаны активами), признаются расходами текущего финансового года и списываются в дебет счета 0 401 20 273 "Чрезвычайные расходы по операциям с активами".

Для учета имущества, не соответствующего критериям актива (п. 36 федерального стандарта "Концептуальные основы", утв. приказом Минфина России от 31.12.2016 № 256н), используется забалансовый счет 02. До момента демонтажа (утилизации, уничтожения) объекта незавершенного строительства учреждению следует учитывать его на забалансовом счете 02 в условной оценке "один объект, один рубль".

В новых практических статьях справочника хозяйственных операций по "1С:БГУ 8" для бюджетных и автономных учреждений показано, как в программе списать объект незавершенного строительства.