Для формирования себестоимости готовой продукции, работ, услуг предназначен счет 109 00 (п. 134 инструкции, утв. приказом Минфина России от 01.12.2010 № 157н, далее - Инструкция № 157н).

Прямые затраты учитываются на счете 109 60 "Себестоимость готовой продукции, работ, услуг". Все расходы, которые связаны с выполнением конкретного вида работ, услуг в рамках одного вида деятельности, относятся к прямым. Они сразу учитываются по дебету счета 109 60 (п. 134 Инструкции № 157н).

Если расходы по какому-либо виду деятельности учреждения нельзя отнести на один вид выполняемой работы, услуги, применяется счет 109 70 "Накладные расходы производства готовой продукции, работ, услуг". Этот счет также применяется для формирования себестоимости выполняемых работ, оказываемых услуг. Расходы, относимые на этот счет, те же самые, что относятся на счет 109 60.

Для учета общехозяйственных расходов используется счет 109 80. По дебету счета 109 80 учитываются затраты на нужды управления, не связанные непосредственно с производственным процессом (процессом оказания услуг, выполнения работ) (п. 135 Инструкции № 157н).

После принятия к учету накладных и общехозяйственных затрат на счета 109 70, 109 80 соответственно они распределяются при формировании фактической стоимости работ (услуг). Распределение этих затрат, произведенных за отчетный период (месяц) при формировании фактической стоимости работы (услуги), отражается по дебету счета 109 60. Накладные и общехозяйственные расходы распределяются способом, утвержденным в учетной политике учреждения.

В новых практических статьях справочника хозяйственных операций по "1С:БГУ 8" для бюджетных и автономных учреждений показано, как в программе вести учет прямых, накладных и общехозяйственных расходов при оказании услуг.