Учет остатков незавершенного производства в программе возможен с использованием или без использования документа "Инвентаризация НЗП".
О том, в каких случаях документ используется, в каких нет, а также как отразить остатки НЗП в бухгалтерском и налоговом учете при выполнении работ, см. в обновленных статьях "Справочника хозяйственных операций. 1С:Бухгалтерия 8":