Согласно п. 84 инструкции, утв. приказом Минфина России от 01.12.2010 № 157н, сумма амортизации отражает величину стоимости основных средств, нематериальных активов, закрепленных за учреждением на праве оперативного управления, которая перенесена на уменьшение финансового результата за период использования объектов.

Снижение стоимости основных средств в результате их амортизации отражается по подстатье 411 КОСГУ (разд. V указаний, утв. приказом Минфина России от 01.07.2013 № 65н).

В обновленных практических статьях справочника хозяйственных операций по "1С:БГУ 8" для казенных учреждений показано, как в программе начислить амортизацию по основным средствам, которые числились на начало года.