Стоимость товаров, которые были реализованы покупателю, но не оплачены поставщику, а потому не приняты в расходы по упрощенной системе налогообложения (УСН), можно учесть в расходах для исчисления налога на прибыль на дату перехода на общую систему налогообложения (ОСН). Если при переходе организации с УСН на ОСН в учете числятся непроданные товары, их стоимость следует отразить в налоговом учете по ОСН. Суммы НДС по непроданным товарам, предъявленные поставщиками, при наличии счета-фактуры можно принять к вычету, если они будут использованы в деятельности, облагаемой НДС.
О том, как это сделать в программе, см. в новой статье "Справочника хозяйственных операций. 1С:Бухгалтерия 8":