Покупатель, перечисливший сумму предоплаты в счет предстоящих поставок товаров (работ, услуг), может принять НДС к вычету, если перечисление предоплаты предусмотрено договором и от продавца получен соответствующий счет-фактура.
Поскольку оплатить товар (работу, услуги) покупатели обязаны в любом случае, иногда они уплачивают сумму аванса, превышающую сумму, указанную в договоре. В такой ситуации покупатель вправе принять к вычету НДС со всей перечисленной суммы аванса – запрета Налоговый кодекс не содержит.
На это указал Минфин России в письме от 12.02.2018 № 03-07-11/8323.
Подробнее о вычете НДС с аванса см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".