НДС по счету-фактуре, заверенному факсимильной подписью, к вычету не принимается.

К такому выводу пришел Минфин России в письме от 08.12.2017 № 03-03-06/1/81951.

В обоснование позиции финансовое ведомство указало, что факсимиле (или аналог собственноручной подписи) используется только в случаях, предусмотренных законом (п. 2 ст. 160 ГК РФ), а использование счетов-фактур, подписанных факсимильной подписью, статья 169 НК РФ не предусматривает.

Подробнее об использовании счетов-фактур, подписанных факсимиле, см. справочник "Налог на добавленную стоимость".