При регистрации ЭТрН в части маркируемого груза (попадающего под требования маркировки) должны ли данные совпадать с УПД? Если да, то какие нужно указывать в ЭТрН (идентификаторы, названия, коды и пр.)?

ГИС ЭПД не проверяет совпадение данных с УПД. Тем не менее для универсальности документооборота рекомендуется, чтобы данные совпадали. Также расхождение сведений может вызвать вопросы у проверяющих органов. При необходимости указания сведений о маркировке необходимо отметить, что в составе груза присутствует товар, перевозка которого подлежит учету в государственной системе.