В соответствии с требованиями ФСФАР организации оптовой и розничной торговли должны вести учет продукции в ЕГАИС. Схема ведения отражена в опубликованном на сайте ФСРАР документе "Методические рекомендации по ведению помарочного учета в ЕГАИС". О том, как вести учет остатков нереализованной продукции, написано в инструкции ФСФАР "Ведение остатков продукции организациями розничной торговли в системе ЕГАИС (с правками от 25.04.2016)".
Под пересортицей подразумевается ситуация, когда вместо одного товара на балансе в ЕГАИС числится другой – например, водка одного наименования, но разных производителей. По предписаниям ФСРАР перед постановкой на баланс с основанием "Пересортица" в ЕГАИС должен быть зарегистрирован акт списания из торгового зала с тем же основанием на аналогичное количество продукции. Отражение пересортицы в ЕГАИС возможно через фиксацию акта списания и акта постановки на учет.