Если вам не нравится стандартное цветовое оформление, которое использует схема данных, вы можете изменить его.
Нажмите в контекстном меню проекта в панели Навигатор 1С:Предприятие.
Здесь вы можете выбрать одну из предопределенных тем для оформления схем данных или задать собственные цветовые настройки.
В соседней группе параметров вы можете изменить стиль линий схемы данных.
