Не нужно восстанавливать НДС по тем объектам, которые на момент перехода на УСН учитываются на забалансовом счете в качестве МПЗ.
Подобный вывод содержится в постановлении ФАС Волго-Вятского округа от 27.01.2014 № А11-9700/2012. Организация при переходе с ОСНО на УСН не восстановила НДС, ранее принятый к вычету, со стоимости оборудования и материалов, которые к моменту перехода на спецрежим были переданы в аренду и установлены в торговых залах. Стоимость данного имущества в налоговом учете она списала на материальные расходы, а в бухучете отразила на забалансовых счетах как материально-производственные запасы (МПЗ). Однако налоговый орган потребовал восстановить налог по спорному оборудованию, руководствуясь тем, что оно более не будет использоваться в деятельности, облагаемой НДС, являясь при этом товаром, предназначенным для реализации (пп. 2 п. 3 ст. 170 НК РФ, п. 3 ст. 38 НК РФ). Однако суд не поддержал проверяющих, пояснив, что в данной ситуации спорное имущество не относится ни к товарам, ни к ОС. А нормами НК РФ не предусмотрена обязанность восстановить НДС со стоимости МПЗ, учитываемых на забалансовом счете.
Подробнее об особенностях налогообложения при применении УСН см. Справочник "Упрощенная система налогообложения".