По общему правилу средства, выплаченные из чистой прибыли на лечение и медицинское обслуживание работников, не облагаются НДФЛ (п. 10 ст. 217 НК РФ). Минфин России в письме от 24.09.2013 № 03-04-06/39635 уточнил, что с оплаты указанных услуг налог не удерживается только при наличии документов от сотрудника, подтверждающих целевое использование средств. Если такие документы работник не представит, необходимо удержать НДФЛ с выплаченных сумм. К тому же не включается в базу по НДФЛ лишь та суммы оплаты лечения (медобслуживания), которая равна стоимости данных услуг. Таким образом, с разницы между величиной предоставленных средств и фактической стоимостью лечения (медобслуживания) потребуется удержать НДФЛ.

Подробнее о доходах, не облагаемых НДФЛ, см. Справочник "Налог на доходы физических лиц".