Воспользоваться правом на вычет НДС можно в любом налоговом периоде в течение трех лет с момента, когда оно возникло.
В постановлении от 23.09.2013 № А40-170181/12-115-1257 ФАС Московского округа рассмотрел вопрос о том, может ли налогоплательщик самостоятельно определять, когда ему заявлять вычет НДС. Так, право на вычет налога возникло у организации в одном налоговом периоде, но она заявила его в другом, более позднем. При этом на момент заявления вычета все требования ст. 172 НК РФ были соблюдены, а также не был нарушен трехлетний срок, предусмотренный п. 2 ст. 173 НК РФ. Тем не менее действия налогоплательщика инспекция посчитала неправомерными и в вычете НДС отказала. По мнению налогового органа, в данной ситуации следовало представить уточненную декларацию за тот налоговый период, в котором у организации возникло право на вычет НДС, вместо того чтобы заявлять вычет в более позднем налоговом периоде. Однако суд пришел к выводу, что данное обстоятельство не может лишить налогоплательщика права на обоснованную налоговую выгоду. Следовательно, инспекция безосновательно отказала организации в вычете НДС.
Подробнее о перенесении вычета НДС на более поздний период см. Справочник "Налог на добавленную стоимость".