В постановлении от 13.08.2013 № А56-60218/2012 ФАС Северо-Западного округа рассмотрел следующую ситуацию. Налогоплательщик заявил вычет НДС по счетам-фактурам, полученным от контрагента, который предоставлял ему вагоны для перевозки грузов за рубеж. Контрагент предъявил налогоплательщику НДС по ставке 18 процентов, однако инспекция в вычете отказала, мотивировав это тем, что данная ставка применена неверно. Суд встал на сторону налогового органа и указал следующее. Услуги по предоставлению подвижного состава для международных перевозок, которые были оказаны налогоплательщику, облагаются по нулевой ставке (пп. 2.1 п. 1 ст. 164 НК РФ). Его контрагент не имел права изменять законодательно установленную ставку налога по собственному усмотрению, так как это не предусмотрено положениями главы 21 НК РФ. Примененная в счетах-фактурах ставка НДС 18 процентов не соответствует положениям пп. 10 п. 5 ст. 169 НК РФ. С учетом данных обстоятельств суд пришел к выводу, что спорные счета-фактуры не являются основанием для вычета НДС.

Подробнее о правомерности вычета НДС, предъявленного по неверной ставке, см. Справочник "Налог на добавленную стоимость".