Доплата, перечисленная работнику в связи с повышением размера материальной помощи, облагается НДФЛ. Такая позиция Минфина России отражена в письме от 16.08.2013 № 03-04-06/33543. Суть вопроса к ведомству состояла в следующем. После предоставления отдельным работникам материальной помощи в коллективный договор были внесены изменения, в соответствии с которым ее размер увеличился. Для того чтобы не допустить дискриминации между сотрудниками, работодатель издал новые приказы о доплате сумм материальной помощи до нового размера тем работникам, которые ее уже получили по прежним условиям договора. Минфин России указал, что материальная помощь в связи с рождением ребенка, которая выплачена на основании новых приказов, не признается единовременной выплатой (п. 8 ст. 217 НК РФ). Она является доходом работника, с которого необходимо удержать НДФЛ. Рассчитать налог нужно даже в том случае, если величина такой материальной помощи, предоставленной на основании нескольких приказов, в совокупности не превысит не облагаемого НДФЛ предела в 50 000 рублей.

Подробнее о доходах, не облагаемых НДФЛ, см. Справочник "Налог на доходы физических лиц".