Организация может предоставить сотрудникам корпоративный транспорт, компенсировать им расходы на его содержание и обслуживание, а затем учесть такую компенсацию в расходах на оплату труда. К такому выводу пришел ФАС Московского округа в постановлении от 03.07.2013 № А40-92882/12-91-495. В соответствии с трудовыми договорами работодатель предоставлял сотрудникам служебный транспорт в зависимости от их ранга и должности в целях дополнительного стимулирования, а также в связи с разъездным характером работ. Затраты сотрудников, связанные с использованием служебных автомобилей, компенсировались. Обязанность работодателя осуществлять компенсационные выплаты была предусмотрена в трудовом договоре, а транспорт использовался в служебных целях. С учетом этих обстоятельств суд пришел к выводу, что данные компенсационные выплаты являются частью заработанной платы (ст. 129 ТК РФ), и налогоплательщик правомерно учел их в составе расходов на оплату труда (п. 25 ст. 255 НК РФ). 

Подробнее об учете расходов на содержание служебного транспорта и на выплату компенсаций в связи с его использованием см. Справочник "Налог на прибыль организаций".