Налогоплательщик не должен восстанавливать НДС по приобретенным товарно-материальным ценностям, списанным в результате порчи.
К такому выводу пришел ФАС Московского округа в постановлении от 28.06.2013 № А40-113901/12-90-576. В рассматриваемой ситуации организация списала служебный автомобиль, который попал в аварию и не подлежал ремонту. Инспекция посчитала, что поскольку автомобиль больше не используется в облагаемой НДС деятельности, то организация обязана была восстановить "входной" налог. Суд указал, что перечень оснований для восстановления НДС, приведенный в п. 3 ст. 170 НК РФ, является закрытым и среди них не указано списание и уничтожение ТМЦ в результате порчи. Исходя из этого, обязанности восстановить "входной" НДС у налогоплательщика не возникало.
Подробнее о восстановлении НДС при порче товарно-материальных ценностей см. Справочник "Налог на добавленную стоимость".