В письме от 16.05.2013 № 03-07-11/17002 Минфин России рассмотрел вопрос о том, может ли организация при переходе с УСН на общий режим налогообложения принять к вычету НДС по объекту недвижимости, который не был введен в эксплуатацию в период применения УСН.

Финансовое ведомство разъяснило, что при переходе с УСН на общий режим налогообложения к вычету принимается НДС по товарам (работам, услугам, имущественным правам), которые не были включены в расходы при УСН (п. 6 ст. 346.25 НК РФ). Согласно пп. 1 п. 3 ст. 346.16 НК РФ затраты на сооружение основных средств учитываются в расходах при УСН с момента ввода их в эксплуатацию. Следовательно, если основное средство не было введено в эксплуатацию в период применения спецрежима, то затраты на его сооружение в расходы не включались. Учитывая это, при переходе организации на общий режим налогообложения НДС по товарам (работам, услугам), который предъявлен подрядными организациями (заказчиками-застройщиками) при проведении капитального строительства, а также НДС по товарам (работам, услугам), которые были приобретены для выполнения этих работ, подлежит вычету в общеустановленном порядке.

Подробнее о налогообложении при переходе на общий режим см. Справочник "Упрощенная система налогообложения"