Минфин России в письме от 12.04.2013 № 03-03-07/12256 рассмотрел вопрос о том, каким документом подтвердить расходы на приобретение электронного железнодорожного билета. Финансовое ведомство напомнило, что на основании п. 1 Приложения к приказу Минтранса России от 21.08.2012 № 322 (далее - Приложение) при покупке электронного билета информация о перевозке пассажира вносится в автоматизированную систему. При оформлении электронного билета также формируется контрольный купон, который в обязательном порядке направляется в электронном виде пассажиру (п. 5 Приложения). Таким образом, документом, подтверждающим расходы на приобретение железнодорожного билета, является контрольный купон, полученный в электронном виде по информационно-телекоммуникационной сети.

Подробнее об учете расходов на командировки см. Справочник "Налог на прибыль организаций"