На проценты, уплаченные при приобретении муниципального имущества в рассрочку, НДС не начисляется.
ФАС Западно-Сибирского округа в постановлении от 11.04.2013 № А67-2168/2012 рассмотрел вопрос о том, нужно ли начислять НДС на проценты, уплаченные при приобретении муниципального имущества в рассрочку. Суд указал, что на основании ст. 823 ГК РФ и ст. 153 НК РФ эти проценты являются платой за коммерческий кредит, а не за реализацию имущества. Таким образом, они относятся к внереализационным доходам и не являются объектом обложения НДС. Следовательно, налоговый агент не должен уплачивать НДС с процентов за предоставление рассрочки при покупке муниципального имущества.
Подробнее о том, нужно ли налоговым агентам включать в налоговую базу по НДС проценты за предоставленную рассрочку при приобретении имущества казны см. Справочник "Налог на добавленную стоимость"