Если организация досрочно списала и демонтировала оборудование, а его остатки реализовала в виде лома, то ранее принятый к вычету НДС восстанавливать не нужно.
ФАС Западно-Сибирского округа в постановлении от 01.04.2013 № А27-15357/2012 рассмотрел следующую ситуацию. Организация приобрела оборудование, предъявленный НДС по которому приняла к вычету. Данные основные средства оказались непригодными для использования в производстве, в связи с чем они были досрочно списаны и демонтированы, а их остатки реализованы в качестве лома. Инспекция посчитала, что организация должна восстановить ранее принятый к вычету НДС в соответствии с пп. 2 п. 3 ст. 170 НК РФ. Однако суд указал, что у налогоплательщика такая обязанность отсутствует, поскольку перечень оснований для восстановления НДС, указанный в п. 2 ст. 170 НК РФ, является закрытым. В нем не предусмотрено восстановление НДС по товарам, остатки которых после списания и демонтажа были реализованы в виде лома.
Подробнее о восстановлении НДС при списании недоамортизированных основных средств, см. в Справочнике "Налог на добавленную стоимость"