В письме от 05.02.2013 № 03-07-14/08 Минфин России рассмотрел вопрос о том, может ли организация принять к вычету НДС до выпуска товаров, ввозимых в РФ, если она уплатила таможенному органу авансовые платежи.

Ссылаясь на п. 2 ст. 171 и п. 1 ст. 172 НК РФ, финансовое ведомство разъяснило, что при ввозе товаров на территорию РФ НДС принимается к вычету после принятия товаров на учет и на основании документов, подтверждающих фактическую уплату налога. Вместе с тем перечисление таможенному органу авансовых платежей уплатой налога не является. Это следует из п. 3 ст. 73 ТК ТС, согласно которому внесенные авансовые платежи не могут рассматриваться как уплата налога до тех пор, пока организация не сделает распоряжение об этом таможне либо таможня не обратит взыскание на указанные платежи. Названным распоряжением со стороны организации является представление в таможенный орган таможенной декларации либо совершение иных действий, свидетельствующих о намерении организации использовать свои денежные средства в качестве уплаты таможенных платежей и налогов. Таким образом, учитывая сказанное, уплата авансовых платежей таможне не является основанием для вычета НДС по товарам, ввозимым в РФ.

Подробнее см. Справочник "Налог на добавленную стоимость"