Суммы, выплачиваемые при однодневных командировках, не облагаются НДФЛ в полном объеме, если они документально подтверждены.
Минфин России в письме от 01.03.2013 № 03-04-07/6189 рассмотрел вопрос о том, нужно ли облагать НДФЛ денежные средства, выплачиваемые при однодневной командировке. Финансовое ведомство указало, что данные выплаты не являются суточными. В силу ст. 168 ТК РФ они носят характер иных расходов, связанных с командировкой и произведенных с разрешения или ведома работодателя. Они не облагаются НДФЛ в полном объеме, если подтверждены документально. Финансовое ведомство со ссылкой на постановление Президиума ВАС РФ от 11.09.2012 № 4357/12 указало, что при отсутствии документального подтверждения эти суммы не облагаются НДФЛ в пределах 700 рублей для командировок по РФ, 2 500 рублей для командировок за границу.
Подробнее см. Справочник "Налог на доходы физических лиц"