ФАС Дальневосточного округа в постановлении от 25.01.2013 № Ф03-5923/2012 рассмотрел следующую ситуацию. Организация оплачивает своему работнику аренду жилья. При этом арендная плата передается непосредственно арендодателю - физическому лицу. При перечислении денежных средств организация удерживала НДФЛ в отношении арендодателя. С работника НДФЛ не удерживался. Инспекция посчитала, что работник в данной ситуации получал доход в натуральной форме, с которого следует удержать налог. Суд указал, что по смыслу п. 1 ст. 211 НК РФ доход должен быть получен налогоплательщиком непосредственно от организации. В данном случае доход получал арендодатель, а не сотрудник. Поэтому оснований для удержания НДФЛ не имеется.

Подробнее см. Справочник "Налог на доходы физических лиц"