Как известно, налогоплательщики, применяющие УСН, не признаются плательщиками НДС за исключением налога, уплачиваемого (п. 2, 3 ст. 346.11 НК РФ):

• при ввозе товаров на территорию РФ и иные территории, находящиеся под ее юрисдикцией;

• на основании ст. 174.1 НК РФ.

Однако в случае выставления таким налогоплательщиком покупателю товаров (работ, услуг) счета-фактуры, указанная в нем сумма НДС подлежит перечислению в бюджет (п. 5 ст. 173 НК РФ). Кроме того, по мнению контролирующих органов, данная сумма отражается в составе доходов налогоплательщика (см. письма Минфина России от 21.09.2012 № 03-11-11/280, от 14.04.2008 № 03-11-02/46, УФНС России по г. Москве от 02.11.2010 № 16-15/115179@).

Обращаем ваше внимание, что согласно новой редакции п. 1 ст. 346.15 НК РФ с 1 января 2016 года налогоплательщик, применяющий УСН, вправе не отражать в составе доходов сумму НДС по выставленному покупателю счету-фактуре. Связано это с тем, что при определении объекта налогообложения при УСН доходы будут учитываться в порядке, установленном п. 1, 2 ст. 248 НК РФ. Следовательно, суммы НДС, предъявленные покупателю (приобретателю) товаров (работ, услуг, имущественных прав), из доходов исключаются (абз. 3 п. 1 ст. 248 НК РФ).

Данные поправки в НК РФ внесены Федеральным законом от 06.04.2015 № 84-ФЗ "О внесении изменений в часть вторую Налогового кодекса Российской Федерации". Об этом напомнил Минфин России в письме от 21.08.2015 № 03-11-11/48495.

Подробнее об уплате НДС упрощенцем см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".