В случае если продавец получил от покупателя предоплату в счет предстоящей отгрузки товаров (работ, услуг), он должен выставить ему счет-фактуру на аванс не позднее 5 календарных дней со дня ее получения (см. п. 3 ст. 168 НК РФ). Но если в течение указанного срока продавец отгрузил товары (выполнил работы, оказал услуги), то счет-фактуру на аванс покупателю выставлять не следует. На это указал Минфин России в письме от 18.01.2017 № 03-07-09/1695.

Ранее финансовое ведомство высказывало аналогичную точку зрения (письма Минфина России от 10.11.2016 № 03-07-14/65759, от 12.10.2011 № 03-07-14/99 и др.).

Подробнее о том, нужно ли выставлять счет-фактуру на аванс, если отгрузка товара произведена в течение пяти дней со дня его получения, см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".