Согласно п. 3 ст. 168 НК РФ при получении от покупателя предварительной оплаты в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ, оказания услуг, передачи имущественных прав) продавец должен выставить ему счет-фактуру не позднее пяти календарных дней со дня получения указанных сумм оплаты.

В то же время если в течение указанного срока продавец произвел отгрузку товаров (выполнил работы, оказал услуги, передал имущественные права) в счет этого аванса, то счета-фактуры на аванс выставлять покупателю не следует.

Такие разъяснения даны в письме Минфина России от 10.11.2016 № 03-07-14/65759.

Ранее Минфин высказывал аналогичную точку зрения (письма от 12.10.2011 № 03-07-14/99, от 06.03.2009 № 03-07-15/39).

Подробнее о том, нужно ли покупателю выставлять счет-фактуру на аванс, если товар отгружен в течение пяти дней со дня его получения, см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".