Законодатель внес изменения в порядок уплаты НДФЛ с выплат военнослужащим и лицам гражданского персонала Вооруженных Сил РФ (Федеральный закон от 30.11.2016 № 399-ФЗ, далее – Закон № 399-ФЗ).

В настоящее время при осуществлении указанных выплат налоговым агентом является Минобороны РФ. При этом выплату денежного довольствия, а также функции налогового агента по НДФЛ осуществляет уполномоченный представитель Минобороны РФ – ФКУ "ЕРЦ МО РФ" (ЕРЦ). Однако такой порядок уплаты НДФЛ не был закреплен законодательно, в связи с чем возникали вопросы, кто является налоговым агентом и следует ли платить налог по месту нахождения воинских частей (см. письма Минфина России от 16.11.2012 № 03-04-08/8-408, от 18.08.2016 № 03-04-09/48562).

Законом № 399-ФЗ данный пробел устранен.

Теперь налоговыми агентами по НДФЛ будут выступать российские организации, которые перечисляют денежное довольствие (содержание, зарплату, иные вознаграждения) военнослужащим и лицам гражданского персонала Вооруженных Сил РФ, то есть ЕРЦ. Удержанную сумму НДФЛ эта организация будет перечислять в бюджет по месту своего учета в налоговых органах.

Причем ЕРЦ может встать на учет, соответственно, перечислять НДФЛ по месту нахождения воинских частей, военным и сотрудникам которых производятся выплаты (п. 1 ст. 1 Закона № 399). Изменения вступают в силу с 1 января 2017 года.