По итогам налогового периода индивидуальные предприниматели исчисляют и уплачивают НДФЛ с доходов от деятельности (пп. 1 п. 1 ст. 227 НК РФ). При этом исчисленную за налоговый период сумму НДФЛ можно уменьшить на перечисленные в бюджет авансовые платежи по этому налогу (п. 9 ст. 227 НК РФ).

Если предприниматель осуществляет торговую деятельность в Москве, то он обязан уплачивать еще и торговый сбор. Сумму сбора можно также учесть при расчете НДФЛ по итогам года (п. 1 ст. 411 НК РФ, п. 5 ст. 225 НК РФ).

По мнению Минфина России, это означает, что при расчете НДФЛ за налоговый период предприниматель в первую очередь должен уменьшить сумму налога на величину уплаченного (в этом налоговом периоде) торгового сбора. Только после этого учитывать суммы фактически уплаченных авансовых платежей по НДФЛ.

Если размер торгового сбора превышает сумму НДФЛ к уплате, вернуть сумму превышения налогоплательщик не может. Такое мнение финансовое ведомство высказало в письме от 12.09.2016 № 03-04-07/53154 (направлено письмом ФНС России от 21.09.2016 № БС-4-11/17680).

Подробнее об учете торгового сбора для целей НДФЛ см. в справочнике "Торговый сбор".