Работодатель обязан перечислять суммы исчисленного и удержанного налога не позднее дня, следующего за днем выплаты работникам дохода. При выплате доходов в виде пособий по временной нетрудоспособности (включая пособие по уходу за больным ребенком) и в виде оплаты отпусков суммы исчисленного и удержанного налога требуется перечислять не позднее последнего числа месяца, в котором производились такие выплаты (п. 6 ст. 226 НК РФ).

Начиная с релиза программы 3.0.44, можно вести учет заработной платы сотрудников обособленного подразделения, перечислять НДФЛ в налоговую по месту регистрации этого подразделения, а также перечислять НДФЛ за определенных сотрудников.

Более подробно об этом смотрите в статье справочника "Кадровый учет и расчеты с персоналом в программах 1С":

• Учет перечисленного НДФЛ.