На период нахождения сотрудника в командировке за ним сохраняется средний заработок (ст. 167 ТК РФ, п. 9 Положения, утв. постановлением Правительства РФ от 13.10.2008 № 749, далее – Положение). Кроме того, ему компенсируются расходы на проезд и расходы по найму жилья, а также выплачиваются суточные (ст. 168 ТК РФ, п. 10 Положения).

Срок командировки работодатель определяет самостоятельно в зависимости от объема и сложности служебного задания (п. 4 Положения). Таким образом, командировка (в том числе за рубеж) может быть достаточно продолжительной.

Для удержания НДФЛ при каждой выплате дохода необходимо определять налоговый статус физлица – резидент РФ или нерезидент. От этого зависит ставка НДФЛ. Выплаты налоговым резидентам РФ от источника в России облагаются по ставке 13 процентов, а нерезидентам – по ставке 30 процентов (п. 1, 3 ст. 224 НК РФ).

Согласно п. 2 ст. 207 НК РФ физлица признаются налоговыми резидентами РФ, если находятся на территории России не менее 183 календарных дней в течение 12 следующих подряд месяцев. Таким образом, при длительной загранкомандировке средний заработок сотрудника (в зависимости от его статуса) облагается НДФЛ с применением ставки 13 либо 30 процентов. Это подтверждают специалисты налоговой службы в письме от 13.07.2016 № ОА-3-17/3228@.

Также в этом письме ФНС России пояснила порядок удержания НДФЛ с суточных при загранкомандировке. Так, в соответствии с п. 3 ст. 217 НК РФ суточные при таких командировках освобождаются от обложения НДФЛ в размере не более 2500 руб. за каждый день командировки. В ведомстве подчеркнули, что освобождение действует вне зависимости от налогового статуса командированного работника.

Подробнее об удержании НДФЛ с выплат при командировке см. справочник "Налог на доходы физических лиц".