Если контрагент указал неверную ставку в счете-фактуре, вычет НДС по нему неправомерен.
Между обществом и его контрагентом был заключен договор на оказание транспортно-экспедиционных услуг, сопутствующих международной перевозке грузов. Согласно пп. 2.1 п. 1 ст. 164 НК РФ такие услуги облагаются НДС по нулевой ставке. Однако контрагенты применяли к ним ставку НДС в размере 18 процентов, выделяя ее в счетах-фактурах. На основании полученных счетов-фактур общество заявило вычет НДС. Но инспекция в вычете отказала, указав, что он невозможен, поскольку контрагент применил ненадлежащую налоговую ставку. Суд согласился с мнением налогового органа, пояснив следующее. Если в соответствии с нормами НК РФ операция должна облагаться НДС по определенной ставке (к примеру, по ставке 0 процентов), налогоплательщик не вправе по своему усмотрению изменять ее. В противном случае счет-фактура с иной ставкой налога будет считаться выставленным с нарушением требования пп. 10 п. 5 ст. 169 НК РФ. Следовательно, вычет НДС по нему заявить нельзя (п. 2 ст. 169 НК РФ).
В спорной ситуации ставка НДС в полученных счетах-фактурах не соответствовала той ставке, которая подлежала применению по требованию пп. 2.1 п. 1 ст. 164 НК РФ. Поэтому общество не имело право на вычет налога. К такому выводу пришел АС Московского округа в постановлении от 09.02.2015 № Ф05-15266/2014.
Подробнее об этом см. статью-рекомендацию справочника "Налог на добавленную стоимость".